2005年，为了满足业务发展的资金需要，中国农业发展银行加大了市场化筹资力度，使长期以央行再贷款为主的单一负债结构进一步得到改善，筹资多元化进程明显加快。截至年末，央行再贷款占中国农业发展银行负债总额的比例由84%降为63%；金融债券占比由6%提高到21%；存款占比由10%提高到12%；协议存款从无到有，占比达到4%。
　　加大了金融债券发行力度。通过精心组织，实现了全年17期金融债券全部成功发行，无一期流标。在两次追加发行后，发行总量由原定1200亿元增至2001亿元，同比增加四倍，占到政策性金融债券年度发行总量的33%。与此同时，坚持与业务发展相匹配，以“短中结合”为基调，合理设计债券品种和期限，不断优化债券结构。目前，中国农业发展银行金融债券期限已涵盖半年期至七年期等多个品种。
　　加强了存款组织与管理工作。经监管部门批准，中国农业发展银行加大了存款营销力度，开办了单位通知存款、协议存款、同业存款等新品种，形成了完整的单位存款品种系列，年内存款快速增长。年末各项存款余额1261.5亿元，比年初增加了505.7亿元，其中企业和专项存款增加194.2亿元，邮政储蓄协议存款增加300亿元，同业存款增加11.5亿元。
　　通过开办同业拆借，增强了资金营运能力。经过认真筹备，下半年成功开办了人民币同业拆借业务，利用28亿元的拆借限额，全年共完成拆借业务9笔，拆借金额222亿元。年末，人民银行将中国农业发展银行拆借限额由28亿元提高到84亿元。
　　认真做好财政支农资金的代理拨付工作。2005年，由各级财政部门筹措进入中国农业发展银行各级专户的各项补贴资金1043亿元，同比多筹21亿元，筹措到位率99%，同比提高1个百分点。各项财政补贴资金综合拨补到位率88%，同比提高2个百分点。
　　改善资金调拨方式，增加资金调拨次数，减少了系统内头寸占用。全年共调拨资金7.9万笔，4289亿元，同比增加9000多笔，542亿元，在净下拨资金同比增加651亿元的情况下，分行旬均头寸占用反而减少4.9亿元，下降8.3％。